Prv pat za Stobi vo naukata se progovorilo vo vtorata polovina na 19 vek koga germanskiot iztra`uva~ Halm vo 1850 godina i francuskiot iztra`uva~ L.Heze vo 1860 godina vrz osnova na kamewata zaklu~ile deka e toa gradot za koj se govorelo vo istoriskite krugovi.
Plansko i sistematsko iskopuvawe po~nalo da se vr{i od strana na narodniot muzej od Belgrad vo 1924 godina koga se pronajdeni mnogu vredni eksponati i grade`ni objekti. Iskopuvawata se prodol`uvaaat se do 1941 godina koga poradi svetskata vojna istite se sopreni. Golem del od najdenite eksponati se odneseni vo narodniot muzej vo Belgrad kade se nao|aat i denes iako tie se sopstvenost na Makedonskiot Narod. Povtorno so iskopuvawe e po~nato vo 1952 godina od strana na Nardoniot Muzej na Makedonija a od 1972 se vr{i redovno arheolo{ko istra`uvawe i iskopuvawe na novi mesta...